В подавляющем большинстве случаев острый риносинусит вызывается вирусной инфекцией: риновирусом, реже, коронавирусом, вирусами гриппа и парагриппа, синцитиальным вирусом верхних дыхательных путей, аденовирусом и даже энтеровирусом. В 0,5-2% случаев к вирусному синуситу присоединяется бактериальная инфекция. Бактериальный синусит может быть обусловлен одним или несколькими возбудителями, такими как  стафилококки (S. aureus), стрептококки (S. pneumoniae, S. pyogenes), пневмококки (H. influenza), а также другой флорой (P. aeruginosa M. catarrhalis, E. coli, P. mirabilis, K. pneumoniae, Enterobacter). Грибковые синуситы встречаются очень редко. Непосредственными возбудителями служат Aspergillus и Alternaria, другие виды грибков могут вызывать аллергические синуситы.